ما هي الببتيدات التي تخترق الخلايا؟

الببتيدات التي تخترق الخلايا هي الببتيدات الصغيرة التي يمكن أن تخترق غشاء الخلية بسهولة. هذه الفئة من الجزيئات ، وخاصة CPPs مع وظائف الاستهداف ، تحمل وعدًا بتسليم المخدرات الفعال للخلايا المستهدفة.

لذلك ، فإن البحث عنها لها أهمية طبية حيوية معينة. في هذه الدراسة ، تمت دراسة CPPs مع أنشطة الغشاء المختلفة على مستوى التسلسل ، في محاولة لمعرفة العوامل التي تؤثر على نشاط الغشاء في CPPs ، والاختلافات التسلسلية بين CPPs مع أنشطة مختلفة و NonCPP ، وإدخال طريقة لتحليل التسلسلات البيولوجية.

تم الحصول على تسلسلات CPPs و NonCPPs من قاعدة بيانات CPPSITE وآداب مختلفة ، وتم استخراج الببتيدات عبر الغشاء (HCPPs ، MCPPs ، LCPPs) مع النشاط العالي والمتوسط ​​والمنخفض من الغشاء من تسلسل CPP لبناء مجموعات البيانات. بناءً على مجموعات البيانات هذه ، أجريت الدراسات التالية:

1 ، تم تحليل الأحماض الأمينية وتكوين الهيكل الثانوي لمختلف CPPs النشطة و NonCPPs بواسطة ANOVA. وقد وجد أن التفاعلات الإلكتروستاتيكية والماء للأحماض الأمينية لعبت دورًا مهمًا في نشاط الغشاء في CPPs ، كما أثر البنية الحلزونية واللف العشوائية على نشاط الغشاء في CPPs.

2. تم عرض الخواص الفيزيائية والكيميائية وأطوال CPPs مع أنشطة مختلفة على المستوى ثنائي الأبعاد. وقد وجد أن CPPs و NonCPPs مع أنشطة مختلفة يمكن تجميعها في ظل بعض الخصائص الخاصة ، وتم تقسيم HCPPs ، MCPPs ، LCPPs وغير CPPs إلى ثلاث مجموعات ، تبين خلافاتها ؛

3. في هذه الورقة ، يتم إدخال مفهوم النقط الوسطى الفيزيائية والكيميائية للتسلسل البيولوجي ، وتعتبر البقايا التي تتكون من التسلسل نقاط جسيمات ، ويتم استخلاص التسلسل كنظام جسيمات للبحث. تم تطبيق هذه الطريقة على تحليل CPPs من خلال إسقاط CPPs مع أنشطة مختلفة على المستوى ثلاثي الأبعاد بواسطة طريقة PCA ، ووجد أن معظم CPPs تجمعت معًا وبعض LCPPs تتجمع مع NonCPPs.

هذه الدراسة لها آثار على تصميم CPPs وفهم الاختلافات في تسلسل CPPs مع أنشطة مختلفة. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن أيضًا استخدام طريقة تحليل النقط الوسطى الفيزيائية والكيميائية للتسلسلات البيولوجية التي تم تقديمها في هذه الورقة لتحليل المشكلات البيولوجية الأخرى. في الوقت نفسه ، يمكن استخدامها كمعلمات إدخال لبعض مشاكل التصنيف البيولوجي ولعب دور في التعرف على الأنماط.