ما هي الببتيدات التي تخترق الخلايا؟

الببتيدات التي تخترق الخلايا هي ببتيدات صغيرة يمكنها اختراق غشاء الخلية بسهولة.هذه الفئة من الجزيئات، وخاصة CPPs ذات وظائف الاستهداف، تحمل وعدًا بتوصيل الدواء بكفاءة إلى الخلايا المستهدفة.

لذلك، فإن البحث عنه له أهمية طبية حيوية معينة.في هذه الدراسة، تمت دراسة CPPs ذات أنشطة مختلفة عبر الغشاء على مستوى التسلسل، في محاولة لمعرفة العوامل التي تؤثر على نشاط الغشاء لـ CPPs، والاختلافات التسلسلية بين CPPs ذات الأنشطة المختلفة و NonCPPs، وإدخال طريقة لتحليل التسلسلات البيولوجية.

تم الحصول على تسلسلات CPPs وNonCPPs من قاعدة بيانات CPPsite والآداب المختلفة، وتم استخراج الببتيدات عبر الغشاء (HCPPs، MCPPs، LCPPs) ذات نشاط الغشاء المرتفع والمتوسط ​​والمنخفض من تسلسلات CPPs لإنشاء مجموعات البيانات.بناءً على مجموعات البيانات هذه، تم إجراء الدراسات التالية:

1 ، تم تحليل تكوين الأحماض الأمينية والبنية الثانوية لمختلف CPPs النشطة و NonCPPs بواسطة ANOVA.لقد وجد أن التفاعلات الكهروستاتيكية والكارهة للماء للأحماض الأمينية لعبت دورًا مهمًا في نشاط الغشاء لـ CPPs، كما أثر التركيب الحلزوني واللف العشوائي أيضًا على نشاط الغشاء لـ CPPs.

2. تم عرض الخصائص الفيزيائية والكيميائية وأطوال CPPs ذات الأنشطة المختلفة على المستوى ثنائي الأبعاد.لقد وجد أن CPPs و NonCPPs ذات الأنشطة المختلفة يمكن تجميعها تحت بعض الخصائص الخاصة، وتم تقسيم HCPPs و MCPPs و LCPPs و NonCPPs إلى ثلاث مجموعات، مما يوضح اختلافاتها؛

3. تم في هذا البحث تقديم مفهوم النقطه الوسطى الفيزيائية والكيميائية للتسلسل البيولوجي، وتعتبر المخلفات المكونة للتسلسل بمثابة نقاط جسيمية، ويتم تلخيص التسلسل كنظام جسيمي للبحث.تم تطبيق هذه الطريقة على تحليل CPPs من خلال إسقاط CPPs مع أنشطة مختلفة على المستوى ثلاثي الأبعاد بواسطة طريقة PCA، وقد وجد أن معظم CPPs متجمعة معًا وبعض LCPPs متجمعة مع NonCPPs.

هذه الدراسة لها آثار على تصميم CPPs وفهم الاختلافات في تسلسل CPPs مع الأنشطة المختلفة.بالإضافة إلى ذلك، يمكن أيضًا استخدام طريقة تحليل النقطه الوسطى الفيزيائية والكيميائية للتسلسلات البيولوجية المقدمة في هذه الورقة لتحليل المشكلات البيولوجية الأخرى.وفي الوقت نفسه، يمكن استخدامها كمعلمات مدخلات لبعض مشاكل التصنيف البيولوجي وتلعب دورًا في التعرف على الأنماط.


وقت النشر: 15 يونيو 2023