مخطط التصميم ومحلول سلسلة الببتيد polypeptide

1. ملخص
الببتيدات هي الجزيئات الكبيرة الخاصة بحيث تكون تسلسلها غير عادية في ميزاتها الكيميائية والفيزيائية. يصعب توليف بعض الببتيدات ، في حين أن البعض الآخر سهل التوليف ولكن يصعب تنقيته. المشكلة العملية هي أن معظم الببتيدات قابلة للذوبان بعض الشيء في المحاليل المائية ، لذلك في تنقيتنا ، يجب أن يذوب الجزء المقابل من الببتيد مسعور في المذيبات غير المائية ، وبالتالي ، من المحتمل أن تكون هذه المذيبات أو المخازن المؤقتة تتجه إلى جانب ما يليها. من تصميم الببتيدات للباحثين.

مخطط التصميم ومحلول سلسلة الببتيد polypeptide
ثانياً ، الاختيار الصحيح للببتيدات الصعبة الاصطناعية
1. إجمالي طول التسلسلات الخاضعة للتنظيم
من الأسهل الحصول على الببتيدات من أقل من 15 بقايا لأن حجم الببتيد يزداد وينخفض ​​نقاء المنتج الخام. مع زيادة الطول الإجمالي لسلسلة الببتيد إلى ما بعد 20 بقايا ، تعد كمية المنتج الدقيقة مصدر قلق رئيسي. في العديد من التجارب ، من السهل الحصول على تأثيرات غير متوقعة عن طريق خفض رقم البقايا أقل من 20.
2. قلل من عدد البقايا مسعور
الببتيدات مع غلبة كبيرة من بقايا مسعور ، وخاصة في المنطقة 7-12 من بقايا الطرف C ، عادة ما تسبب صعوبات اصطناعية. يُنظر إلى هذا على أنه مجموعة غير كافية على وجه التحديد لأنه يتم الحصول على ورقة B-Fold في التوليف. "في مثل هذه الحالات ، قد يكون من المفيد تحويل أكثر من بقايا إيجابية وسلبية ، أو وضع Gly أو Pro في الببتيد لإلغاء تأمين تكوين الببتيد."
3. تنظيم المخلفات "الصعبة"
"هناك عدد من Cys ، Met ، Arg ، وتجرب المخلفات التي لا يتم تصنيعها بشكل عام." سيتم استخدام SER عادة كبديل غير مؤكسد لـ CYS.
مخطط التصميم ومحلول سلسلة الببتيد polypeptide

ثالثًا ، تحسين الاختيار الصحيح للذوبان في الماء
1. اضبط الطرف N أو C
بالنسبة إلى الببتيدات الحمضية (أي ، سلبًا مشحونة عند الرقم الهيدروجيني 7) ، يوصى بشكل خاص بالسيتيل (N-terminus acetylation ، CATINUS CATERANUS دائمًا بمجموعة كربوكسيل مجانية) لزيادة الشحنة السلبية. ومع ذلك ، بالنسبة للببتيدات الأساسية (أي ، مشحونة بشكل إيجابي في الرقم الهيدروجيني 7) ، ينصح بشكل خاص بزيادة الشحنة الإيجابية لزيادة الشحنة الإيجابية.

2. اختصار أو إطالة التسلسل بشكل كبير

تحتوي بعض التسلسلات على عدد كبير من الأحماض الأمينية المسعورة ، مثل TRP و PHE و VAL و ILE و LEU و MET و TYR و ALA ، وما إلى ذلك عندما تتجاوز هذه المخلفات المائية 50 ٪ ، فهي عادة لا يسهل حلها. قد يكون من المفيد إطالة التسلسل لزيادة الأعمدة الإيجابية والسلبية للببتيد. الخيار الثاني هو تقليل حجم سلسلة الببتيد لزيادة الأعمدة الإيجابية والسلبية عن طريق تنظيم بقايا مسعور. كلما كان الجوانب الإيجابية والسلبية أقوى لسلسلة الببتيد ، زاد احتمال رد الفعل بالماء.
3. ضع في بقايا قابلة للذوبان في الماء
بالنسبة لبعض سلاسل الببتيد ، يمكن أن يؤدي الجمع بين بعض الأحماض الأمينية الإيجابية والسلبية إلى تحسين قابلية ذوبان الماء. توصي شركتنا بدمج الطرف N أو C-terminus من الببتيدات الحمضية مع Glu-GLU. تم إعطاء محطة N أو C للببتيد الأساسي ثم Lys-Lys. إذا تعذر وضع المجموعة المشحونة ، فيمكن أيضًا وضع Ser-Gly-Ser في محطة N أو C. ومع ذلك ، لا يعمل هذا النهج عندما لا يمكن تغيير جوانب سلسلة الببتيد.